据了解，蒙医药历史悠久，数千年来保留和积累了众多的蒙医药文物，包括各种蒙医药古籍、文献、医疗器械和制药器具、药材标本和众多散在全区及全国各地的珍贵文物，反映了蒙医药发展的进程和丰富内涵，是蒙医药历史的凝炼与考证，也是蒙古民族文化的重要展示。为进一步挖掘、整理、研究、保护、创新、弘扬、发展蒙医药优秀传统文化，扩大蒙医药文化宣传层次，构建国际、国内蒙医药文化及学术交流平台，更好地展示作为国家级非物质文化遗产蒙医药的渊远历史，提升内蒙古自治区蒙医药文化实力，经内蒙古自治区文化厅批准，内蒙古自治区卫生厅决定在内蒙古自治区国际蒙医医院内建设内蒙古自治区蒙医药博物馆。

　　目前相当一部分蒙医药文物还流散在民间，为了开展古籍文献和文物的抢救性调查及征集工作，内蒙古自治区蒙医药博物馆向民间广泛收集珍贵的蒙医药古籍文献和藏品。